Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms