Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPF3BQ9BZI7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms