Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCO2Q9BYV7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCO2Q9BYV7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms