Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM43Q9BTV4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM43Q9BTV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms