Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms