Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms