Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms