Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC5LQ99459 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC5LQ99459 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms