Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCF12Q99081 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCF12Q99081 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms