Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RSF1Q96T23 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RSF1Q96T23 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms