Protein–RNA interactions for Protein: Q96SI9

STRBP, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRBPQ96SI9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRBPQ96SI9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STRBPQ96SI9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms