Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms