Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms