Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSNARE1Q96NA8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSNARE1Q96NA8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms