Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC114Q96M63 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms