Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms