Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP400Q96L91 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms