Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA3Q96KX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA3Q96KX2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms