Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD1Q96JS3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms