Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS6Q96GS4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms