Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms