Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAF2Q96CS3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms