Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DHX58Q96C10 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX58Q96C10 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms