Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms