Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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