Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF34Q969K3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms