Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD50Q92878 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD50Q92878 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms