Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms