Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms