Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms