Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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