Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms