Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms