Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms