Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSIP1Q8NA03 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms