Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms