Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRACR2BQ8N4Y2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRACR2BQ8N4Y2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms