Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP4Q8N2S1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms