Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP3Q8IZU3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP3Q8IZU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms