Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms