Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms