Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC50Q8IVM0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms