Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PBRM1Q86U86 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PBRM1Q86U86 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PBRM1Q86U86 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms