Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms