Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC46A3Q7Z3Q1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms