Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q7L0L9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q7L0L9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q7L0L9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms