Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM5Q71RC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM5Q71RC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms