Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms