Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED9Q6R2W3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms