Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC174Q6PII3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms